این مجتمع 66 بخش آموزشی و درمانی دارد که تعدادی از اعضای هیئت علمی در راستای وظایف آموزشی و درمانی عهده دار امور اجرایی این بخشها نیز می باشند. اسامی این بخشها به شرح زیر است:

 

 

نام بخش نام رئیس بخش
1 ارتوپدی مردان و زنان دکتر سیدمحمدجواد مرتضوی
2 اورولوژی دکتر محسن آیتی
3 ICU مجتمع دکتر محمدتقی بیگ محمدی
4 بیماریهای عفونی و گرمسیری دکتر حمید عمادی کوچک
5 بیهوشی دکتر سیدمحمد میراسکندری
6 پاتولوژی آناتومیکال و کلینیکال مجتمع دکتر علیرضا عبدالهی
7 پزشکی ورزشی دکتر فرزین حلبچی
8 پزشکی هسته ای دکتر سعید فرزانه فر
9 پوست دکتر زهرا صفاریان
10 پیوند کلیه دکتر محمدرضا خاتمی
11 جراحی 1 دکتر کرم اله طولابی
12 جراحی 2 دکتر سیدحسن امامی رضوی
13 جراحی 3 دکتر محمدصادق فاضلی
14 جراحی 4 دکتر امیر کشوری
15 جراحی 5 دکتر سیدرسول میرشریفی
16 جراحی 1 کانسر دکتر حبیب اله محمودزاده
17 جراحی 2 کانسر دکتر محمدرضا میر
18 جراحی 3 کانسر دکتر محمدعلی محققی
19 جراحی پلاستیک دکتر علی عطری
20 جراحی توراکس دکتر محمدباقر رحیم
21 جراحی قلب دکتر مهرداد صالحی
22 جراحی گوش و حلق و بینی دکتر امیرآروین سازگار
23 جراحی مغز و اعصاب دکتر عبدالرضا شیخ رضایی
24 خون و مدیکال آنکولوژی دکتر غلامرضا توگه
25 داخلی جنرال زنان و مردان دکتر نسیم خواجوی راد
26 داخلی ریه و آندوسکوپی ریه دکتر بشارت رحیمی
27 داخلی گوارش و کبد دکتر ناصر ابراهیمی دریانی
28 رادیوانکولوژی دکتر مهدی عقیلی
29 رادیولوژی مجتمع دکتر حسین قناعتی
30 روان تنی دکتر احمد نوربالا
31 روماتولوژی دکتر عبدالرحمان رستمیان
32 زنان و زایمان دکتر صدیقه حنطوش زاده
33 ژنتیک دکتر عباس شکوری
34 طب اورژانس دکتر محمد افضلی مقدم
35 طب فیزیکی و توانبخشی دکتر سیده زهرا امامی رضوی
36 غدد و متابولیسم دکتر منوچهر خان نخجوانی
37 قلب و مردان و زنان-CCU و آنژیوگرافی دکتر مسعود اسلامی
38 کودکان دکتر مجتبی فاضل
39 مراقبت های دارویی دکتر زهرا جهانگرد
40 نفرولوژی و همودیالیز دکتر محبوب لسان پزشکی
41 نورولوژی دکتر محمدحسین حریرچیان
42 نوزادان و NICU دکتر زیبا مسیبی
43 هپاتوبیلیاری و پیوند کبد دکتر علی جعفریان